شغل الدكتور فوزي المهدي خطة مدير عام مستشفى الهادي شاكر بصفاقس وتولى عدة مناصب في الإدارة العامة للصحة العسكرية من 1996 إلى 2007 وكان مسؤولا على ملف الصحة الالكترونية، كما شغل سنة 2016 منصب مستشار لدى وزير الصحة.
كما كان عضو لجنة التحكيم في المنتدى الدولي للصحة الرقمية.