الزواغي كان لاعبا سابقا بالاولمبي الباجي قبل انتقاله إلى النجم الساحلي، وهو نجل الرئيس الأسبق للأولمبيك حسن الزواغي (ترأس الفريق في مناسبتين 1989/1992 و1996/1998). 
كما سبق لقيس الزواغي أن درب عدة أندية على غرار النجم الساحلي والترجي الجرجيسي ومستقبل قابس ونادي حمام الأنف.